Die Gemeinde Pfatter liegt im südöstlichen Landkreis Regensburg, direkt an der Bundesstraße 8 zwischen Regensburg und Straubing. Sie teilt sich in 12 Gemeindeteile auf, die wiederum den vier Gemarkungen Pfatter, Geisling, Gmünd und Griesau zugeordnet sind. Laut Bayerischer Denkmalliste gibt es insgesamt 26 Bau- und 54 Bodendenkmäler im Gemeindegebiet.